8 Temmuz 2014 Salı. - Vall d'Hebron Institut de Recerca'dan (VHIR) bir araştırmacı ekibi, bugüne kadar tamamen bilinmeyen 518 yeni mikro bakteriyi insan mikrobiyotasında (bağırsak florası) tanımlayan uluslararası bir araştırmaya katıldı.
Bilim adamlarının biyoinformatik analize yeni bir yaklaşım uyguladıkları araştırma, bilinen mikrobik genlerin kataloğunu 3 ila 10 milyon arasında genişletti.
Nature Biotechnology dergisi tarafından Pazar günü yayınlanan bu araştırmanın sonuçları, insan mikrobiyomunun sağlık ve hastalık ile ilişkisini araştırmak için 11.4 milyon avro ile donatılmış Avrupa MetaHIT projesinin (Metagenomics İnsan Bağırsak Sistemi) bir parçasıdır. . Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), bu projeye katılan 13 kişiden biri - ve tek İspanyol merkezi - Dr. Francisco Guarner yönetiminde, incelenen tüm örneklerin buna sahip olmadığını açıkladı bilinmeyen türlerin sayısı.
Bazı bireylerin bağırsak florasının örnekleri bu türlerin çok azına sahiptir ve ayrıntılı olarak analiz edildiğinde, bunların Crohn hastalığı olan hastaların örnekleri olduğunu gördü. Guarner, "Bu, şimdiye kadar bilinmeyen bu türlerin muhtemelen sağlıklı insanların mikrobiyotası ile hastaların mikrobiyotası arasında fark yaratan türler olduğunu gösteriyor."
Araştırmacıya göre, bu veriler bu türleri beslenme müdahaleleriyle kurtarmaya yönelik stratejiler açıyor: liflerin uygulanması, bazı türlerin veya probiyotiklerin seçici büyümesine yardımcı olan prebiyotikler.
Bu bilinmeyen bakteriler muhtemelen "iyi bakteriler" olarak adlandırılır, çünkü enfeksiyona neden olan veya daha önce bilinmeyen veya izole edilmeyen tipik bakteriler değildir. Guarner'e göre, keşfedilen bakteriler izole edilemez çünkü "neredeyse kesinlikle nakledilmek için kolonun dışında hayatta kalmazlardı."
VHIR Fizyoloji ve Sindirim Patofizyolojisi Grubunun çalışmasından ve araştırmacısından sorumlu kişi, keşfedilen yeni türlerin "ekilemez, oksijene çok duyarlı olduklarını, yani çok sıkı anaeroblar olduklarını ve çevrelerine büyük bir bağımlılık kurduğunu belirtti. hayatta. " Guarner, "Aynı nedenden dolayı veritabanlarına gittiğimizde bir iz bulamadık ve şimdiye kadar onlar hakkında hiçbir şey bilmiyorduk." Dedi.
Keşif, bu türlerin "yüzeye çıkmasına" izin veren biyoinformatik analize yeni bir yaklaşım sayesinde mümkün olmuştur.
"Şu anda - Guarner'e göre - dizilenmiş genetik materyalin sadece% 10'u% 95 güvenilirlikle biliniyor. Bu, şu anda üzerinde çalışılan büyük bir gri alan bırakıyor."
Çalışma, onlara bir isim vermenin imkansızlığı nedeniyle adlandırılan 741 farklı metagenomik tür tespit etti. Veritabanları ile karşılaştırıldığında, araştırmacılar bu türlerin 115'inin zaten bilindiğini, 518'inin bilinmediğini gördüler; geri kalan 108 kısmen bilinir.
Guarner, "Şimdi bu metagenomik türlerin genomunun nasıl göründüğünü biliyoruz, ancak adlarını ve soyadlarını bilmiyoruz."
Türleri bilinmeyen küçük bir sayı vardır, ancak cinsiyetleri veya ait oldukları aile vardır ve tarif edilenlerin yaklaşık 200 metagenomik türü hiçbir şekilde sınıflandırılamaz, çünkü genlerinin% 80'inden fazlası tamamen bilinmemektedir. bugün.
Bilim adamlarına göre, insanlarda yaşayan mikroorganizmalar, toplam insan hücresi sayısından 10 kat fazla, yaklaşık 100 milyar.
Bu aynı projenin ilk sonuçları, 2010 yılında 3.300.000 farklı gene işaret etti ve 5.000'i şimdiye kadar bilinmeyen 20.000 farklı fonksiyona dönüştü.
Her insanın bu mikrobiyal genlerden yaklaşık 600.000'i vardır ve 300.000 kişi tüm bireyler arasında sürekli olarak tekrarlanır. Guarner, "Bu yeni çalışmada sayı üç ile çarpıldı ve 9, 879, 896 farklı gene ulaşıldı." Dedi.
Kaynak:
Etiketler:
Diyet-Ve-Beslenme Sağlık Farklı
Bilim adamlarının biyoinformatik analize yeni bir yaklaşım uyguladıkları araştırma, bilinen mikrobik genlerin kataloğunu 3 ila 10 milyon arasında genişletti.
Nature Biotechnology dergisi tarafından Pazar günü yayınlanan bu araştırmanın sonuçları, insan mikrobiyomunun sağlık ve hastalık ile ilişkisini araştırmak için 11.4 milyon avro ile donatılmış Avrupa MetaHIT projesinin (Metagenomics İnsan Bağırsak Sistemi) bir parçasıdır. . Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR), bu projeye katılan 13 kişiden biri - ve tek İspanyol merkezi - Dr. Francisco Guarner yönetiminde, incelenen tüm örneklerin buna sahip olmadığını açıkladı bilinmeyen türlerin sayısı.
Bazı bireylerin bağırsak florasının örnekleri bu türlerin çok azına sahiptir ve ayrıntılı olarak analiz edildiğinde, bunların Crohn hastalığı olan hastaların örnekleri olduğunu gördü. Guarner, "Bu, şimdiye kadar bilinmeyen bu türlerin muhtemelen sağlıklı insanların mikrobiyotası ile hastaların mikrobiyotası arasında fark yaratan türler olduğunu gösteriyor."
"İyi bakteri"
Araştırmacıya göre, bu veriler bu türleri beslenme müdahaleleriyle kurtarmaya yönelik stratejiler açıyor: liflerin uygulanması, bazı türlerin veya probiyotiklerin seçici büyümesine yardımcı olan prebiyotikler.
Bu bilinmeyen bakteriler muhtemelen "iyi bakteriler" olarak adlandırılır, çünkü enfeksiyona neden olan veya daha önce bilinmeyen veya izole edilmeyen tipik bakteriler değildir. Guarner'e göre, keşfedilen bakteriler izole edilemez çünkü "neredeyse kesinlikle nakledilmek için kolonun dışında hayatta kalmazlardı."
VHIR Fizyoloji ve Sindirim Patofizyolojisi Grubunun çalışmasından ve araştırmacısından sorumlu kişi, keşfedilen yeni türlerin "ekilemez, oksijene çok duyarlı olduklarını, yani çok sıkı anaeroblar olduklarını ve çevrelerine büyük bir bağımlılık kurduğunu belirtti. hayatta. " Guarner, "Aynı nedenden dolayı veritabanlarına gittiğimizde bir iz bulamadık ve şimdiye kadar onlar hakkında hiçbir şey bilmiyorduk." Dedi.
Farklı metagenomik türler
Keşif, bu türlerin "yüzeye çıkmasına" izin veren biyoinformatik analize yeni bir yaklaşım sayesinde mümkün olmuştur.
"Şu anda - Guarner'e göre - dizilenmiş genetik materyalin sadece% 10'u% 95 güvenilirlikle biliniyor. Bu, şu anda üzerinde çalışılan büyük bir gri alan bırakıyor."
Çalışma, onlara bir isim vermenin imkansızlığı nedeniyle adlandırılan 741 farklı metagenomik tür tespit etti. Veritabanları ile karşılaştırıldığında, araştırmacılar bu türlerin 115'inin zaten bilindiğini, 518'inin bilinmediğini gördüler; geri kalan 108 kısmen bilinir.
Guarner, "Şimdi bu metagenomik türlerin genomunun nasıl göründüğünü biliyoruz, ancak adlarını ve soyadlarını bilmiyoruz."
Türleri bilinmeyen küçük bir sayı vardır, ancak cinsiyetleri veya ait oldukları aile vardır ve tarif edilenlerin yaklaşık 200 metagenomik türü hiçbir şekilde sınıflandırılamaz, çünkü genlerinin% 80'inden fazlası tamamen bilinmemektedir. bugün.
Bir kişinin 600.000 mikrobiyal geni vardır
Bilim adamlarına göre, insanlarda yaşayan mikroorganizmalar, toplam insan hücresi sayısından 10 kat fazla, yaklaşık 100 milyar.
Bu aynı projenin ilk sonuçları, 2010 yılında 3.300.000 farklı gene işaret etti ve 5.000'i şimdiye kadar bilinmeyen 20.000 farklı fonksiyona dönüştü.
Her insanın bu mikrobiyal genlerden yaklaşık 600.000'i vardır ve 300.000 kişi tüm bireyler arasında sürekli olarak tekrarlanır. Guarner, "Bu yeni çalışmada sayı üç ile çarpıldı ve 9, 879, 896 farklı gene ulaşıldı." Dedi.
Kaynak:
